Nuoren tutkijan palkinto jaetaan seuran vuosipäivän symposiumissa joka toinen vuosi. Palkinnon sääntöjen mukaan palkinnonsaajan tulee olla itsenäisen tutkimuskykynsä osoittanut etevä lääketieteen tutkija, joka ei ole vielä täyttänyt 38 vuotta.
2023 Juha Väyrynen
2021 Joonas Kauppila
2020 Juho Joutsa
2017 Erika Jääskeläinen
2015 Ville Leinonen
2013 Tuomas Rissanen
2011 Markus Juonala
2009 Mikko Niemi
2007 Jukka Westermarck
2005 Mika Rämet
2003 Akseli Hemminki
2001 Kristiina Vuori
1999 Tapio Visakorpi
1997 Olli Ritvos
1995 Marikki Laiho
1993 Tomi Mäkelä
1991 Taina Pihlajaniemi
1989 Hannele Yki-Järvinen
1987 Sirpa Jalkanen
1985 Jukka Finne